Научноизследователският сектор при Софийския университет обхваща дейността на академичния състав по организирането, обслужването и извършването на фундаментални и приложни изследвания, консултантска, експертна, технологична и други дейности, осъществявани въз основа на договори.

НИС работи на принципа на стопанската сметка – приходите и разходите на всеки проект се водят на отделна счетоводна партида и разходите са в рамките на приходите.

Чрез НИС ежегодно се изпълняват над 300 договора, от които над 60 са по програми на Европейската комисия и около 40 - с международни фирми и организации от Европа, Япония и САЩ.

Изследователската дейност обхваща различни области на природните и обществените науки. Особено активни са изявите в следните области:

• информационни технологии;
• микробиология и биотехнологии;
• оптоелектроника и наноматериали;
• синтез на нови органични и неорганични вещества;
• термодинамика и хидродинамика на дисперсни системи;
• физика на плазмата и газовите разряди;
• лабораторни технологии за производство на реактиви;
• лазерна технология и апаратура;
• екология и опазване на природната среда;
• радиоактивно замърсяване на почвата, водата и въздуха;
• регионална геология и геоложко картиране;
• проблеми на висшето образование;
• социални науки;
• религиозни изследвания;
• икономическа оценка на проекти и фирми.