Основната цел на проекта е свързана с определянето на популационната динамика на четири вида тревопасни животни (зубри, коне Коник, благородни елени и елени лопатари) от Източни Родопи и оценка на влиянието на климатичните и сезонни промени върху диетата и здравния им статус.
Тя почива на работна хипотеза 1 – сезонните промени в диетата на тези животни са свързани със съответните промени в чревната биота и от там в популационната динамика.
За да се тества тази хипотеза, основната цел е подразделена на четири подцели:
1 – Дефиниране на популационната структура.
2 – Оценка на видовия състав на растенията в сезонната динамика на храненето.
3 – Характеризиране на сезонната динамика на чревната микробиота.
4 – Мониторинг за наличие на чревни ендопаразитози (хелминтни паразити).
В проектното предложение е залегнала и работна хипотеза 2 – в чревната микробиота са налични потенциални микроорганизми с полезни качества.
За проверката на тази хипотеза е поставена и втората главна цел на проектното предложение, а именно изолиране, култивиране и характеризиране на перспективни видове микроорганизми с добри литични активности за разграждане на трудно разградими полизахариди и/или подпомагащи почвеното здраве, растежа и развитието на растителните видове.