Софийски университет "Св. Климент Охридски"

	Доц. д-р Мартина Трайковска каб. 363, бул. "Драган Цанков" №8, 1164 София, България тел: 089 246 6205 e-mail:m_traykovska@biofac.uni-sofia.bg
Професионални интереси: Синтетична биология, синтетичен контрол на генна експресия, създаване на нови антибактериални, антиракови лекарства, рибопревключватели, аптамери, рибозими Профили в големи бази данни: НАЦИД: https://ras.nacid.bg/dissertation-preview/46647 SCOPUS: https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=56656488000 Web of Science: https://www.webofscience.com/wos/author/record/AAL-2541-2021 Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=en&user=OzgEAzQAAAAJ Авторите СУ: https://authors.uni-sofia.bg/AuthorPublications.aspx?id=8ceb767c-8d74-43d9-951b-05bfffab0fba
ОБРАЗОВАНИЕ
2017: Доктор, професионално направление 4.3. Биологически науки, Катедра “Генетика” Биологически факултет,Софийски университет „Св. Климент Охридски“ 2014-2017: Редовен докторант към катедра “Генетика” 2020 – 2022: Магистър по Управление на Клинични изпитвания, МУ София - Факултет по Обществено Здраве „Проф. Цекомир Воденичаров” 2012 – 2014: Магистър по Генно и клетъчно инженерство, спциалност Биотехнология, Биологически факултет, Софийски Университет „Св. Климент Охридски“ 2008 - 2012: Бакалавър по Молекулярна биология, Биологически факултет, Софийски Университет „Св. Климент Охридски“
ПРОФЕСИОНАЛЕН ОПИТ
Академични длъжности: 2026 – до момента: Доцент, „Лаборатория по Синтетична биология и Биоинформатика“, Биологически факултет, Софийски Университет „Св. Климент Охридски“ 2023 – 2026: Гл. ас. д-р, Лаборатория по „Синтетична биология и Биоинформатика“, Биологически факултет, Софийски Университет „Св. Климент Охридски“ 2018-2023: Гл. ас. д-р, Катедра „Генетика“, Биологически факултет, Софийски Университет „Св. Климент Охридски“
КУРСОВЕ ОКС "бакалавър" Молекулярна генетика (МБ) Биоинформатика (АБТХ) ОКС "магистър" Геномика Синтетична биология Биоинформатика и молекулна еволюция
Изследователски опит: 2023 – до момента: Изследовател към Лаборатория „Синтетична биология и Биоинформатика“, Биологически факултет, Софийски Университет „Св. Климент Охридски“. 2018 – 2023: Изследовател към Катедра „Генетика“, Биологически факултет, Софийски Университет „Св. Климент Охридски“
Научни награди и отличия: I-ва награда за най-добра работа на млад български микробиолог през 2022г. от Фондация „Акад. Проф. д-р Стефан Ангелов“
Най-успешен проект в областта на биологическите науки, представен на Софийския Фестивал на науката, 15-16.05.2021г.
Наукометрични данни: Доц. д-р Мартина Трайковска е автор на 30 научни публикации и глави от книги. Общ брой цитирания в Google Scholar: 299 https://scholar.google.com/citations?hl=en&user=OzgEAzQAAAAJ Брой цитирания през последните 5 години: 244 Брой цитирания в Scopus: 235, H-index: 8 за 17 публикации, https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=56656488000 Брой цитирания в Web of Science: 166, H-index: 7 за 12 публикации, https://www.webofscience.com/wos/author/record/AAL-2541-2021 Авторите СУ: https://authors.uni-sofia.bg/AuthorPublications.aspx?id=8ceb767c-8d74-43d9-951b-05bfffab0fba Общ импакт фактор: 47.4

Научни публикации:

1. Dimitrios Kaloudas, Martina Traykovska, Nikolet Pavlova, Robert Penchovsky, Design and Applications of riboregulators, ISBN:978-981-95395-6-7, Springer, Ref, Рецензирано издание, глава от книга, 2026 https://books.google.bg/books/about/Handbook_of_Synthetic_Biology.html?id=KJma0QEACAAJ&redir_esc=y
2. Vanya Dyakova, Martina Traykovska, Nikolet Pavlova, Dimitrios Kaloudas, Robert Penchovsky, Rational Design of Chimeric Antisense Oligonucleotides that Target FMN Riboswitch mRNAs and Inhibit the Growth of Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus, ACS Infectious Diseases, 2025, ISSN (print):2373-8227, doi:10.1021/acsinfecdis.5c00779, Ref, Web of Science, IF (3.8 - 2025), Web of Science Quartile: Q1 (2025), SCOPUS, SJR (1.241 - 2025), SCOPUS Quartile: Q1 (2025) https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsinfecdis.5c00779
3. Lozena A. Otcheva, Martina Traykovska, Robert Penchovsky, Targeting Bacterial Adenylate Kinase mRNA with a Chimeric Antisense Oligonucleotide for Rational Antibacterial Drug Development, Molecules, vol:30, 2025, ISSN (online): 1420-3049, doi:10.3390/molecules30163425, Ref, IF (4.6 - 2025), Web of Science Quartile: Q1 (2025), SCOPUS, SJR (0.865 - 2025), SCOPUS Quartile: Q1 (2025) https://www.mdpi.com/1420-3049/30/16/3425
4. Nikolet Pavlova, Vanya Dyakova, Martina Traykovska, Dimitrios Kaloudas, Robert Penchovsky, The Application of Aptamers in Pharmacological Drug Development and Therapeutic, ChemistrySelect, vol:10, issue:28, 2025, ISSN (print):2365-6549, ISSN (online):2365-6549, doi:10.1002/slct.202502954, Ref, Web of Science, IF (1.9 - 2024), SCOPUS, SJR (0.366 - 2024), SCOPUS Quartile: Q3 (2025)https://chemistry-europe.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/slct.202502954
5. Martina Traykovska, Robert Penchovsky, Дизайн на антисенс олигонуклеотиди и приложението им като антибактериални агенти: принципи, механизми на действие и предизвикателства, монография ISBN:978-954-07-6132-9, Университетско издателство „Св. Климент Охридски“, София, Ref, Рецензирано, 2025https://penchovsky.atwebpages.com/publications.php?page=3220 Купи от тук: https://unipress.bg/dizayn-na-antisens-oligonukleotidi-i-prilozhenieto-im-kato-antibakterialni-agenti-printsipi-mehanizmi-na-deystvie-i-predizvikatelstva
6. Robert Penchovsky, Antoniya V. Georgieva, Vanya Dyakova, Martina Traykovska and Nikolet Pavlova, Antisense and Functional Nucleic Acids in Rational Drug Development, Antibiotics 2024, IF: 4.3, https://doi.org/10.3390/antibiotics13030221, https://penchovsky.atwebpages.com/publications.php?page=3199
7. Nikolet Pavlova, Martina Traykovska, Robert Penchovsky, “Targeting FMN, TPP, SAM-I, and glmS Riboswitches with Chimeric Antisense Oligonucleotides for Completely Rational Antibacterial Drug Development”, Antibiotics, 2023. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37998809/
8. Martina Traykovska, Robert Penchovsky, “Engineering antisense oligonucleotides as antibacterial agents that target FMN riboswitches and inhibit the growth of Staphylococcus aureus, Listeria monocytogenes, and Escherichia coli”, ACS Synthetic Biology, 2022, ISSN: 2161-5063, doi: 10.1021/acssynbio.2c00013, Q1, IF 5 https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35440139/
9. Martina Traykovska, Robert Penchovsky, “Targeting SAM-I Riboswitch Using Antisense Oligonucleotide Technology for Inhibiting the Growth of Staphylococcus aureus and Listeria monocytogenes”, Antibiotics, 2022, IF 5.0 https://www.mdpi.com/2079-6382/11/11/1662/pdf https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35440139/
10. Martina Traykovska, Lozena A. Otcheva, Robert Penchovsky, “Targeting TPP riboswitches using chimeric antisense oligonucleotide technology for antibacterial drug development“, ACS Applied Bio Materials, 2022, Q1, IF 4.5, doi: 10.1021/acsabm.2c00628 https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36170638/
11. Robert Penchovsky, Nikolet Pavlova, Georgi Miloshev, Antoniya Georgieva, Martina Traykovska, “Versatile Tools of Synthetic Biology applied for Drug Discovery and Production”, Future Medicinal Chemistry, Q2, IF 4.75, 2022 https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35975897/
12. Georgi Y. Miloshev, Martina Traykovska, Dimitrios Kaloudas, Robert Penchovsky, “ENGINEERING A PLASMID AS A REPORTER SYSTEMFOR QUANTIFYING GENE EXPRESSION IN ESCHERICHIA COLI” Proceedings of the Bulgarian Academy of Sciences, 2022 https://www.proceedings.bas.bg/index.php/cr/article/view/7/7
13. Aikaterini Valsamatzi, Martina Traykovska, Robert Penchovsky, “Coronavirus SARS-CoV-2: Where do we stand?“, Acta Microbiologica Bulgarica, ISSN: 26033755, 2022, SJR 0.115, Q4 https://penchovsky.atwebpages.com/publications.php?page=3155
14. Robert Penchovsky, Georgi Miloshev, Nikolet Pavlova, Katya Popova, Lozena Otcheva, Aikaterini Valsamatzi, Martina Traykovska, Book: New Frontiers and Applications of Synthetic Biology; chapter 8. Small RNAbased systems for sensing and therapeutic applications, Elsevier, 2022, ISBN: 9780128244692 https://www.sciencedirect.com/book/edited-volume/9780128244692/new-frontiers-and-applications-of-synthetic-biology
15. Martina Traykovska, Katya B. Popova, Robert Penchovsky, “Targeting glmS Ribozyme with Chimeric Antisense Oligonucleotides for Antibacterial Drug Development”, ACS Synthetic Biology, 2021, doi: https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acssynbio.1c00443, SJR 5.5, Q1 https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34734706/
16. Lozena A Otcheva, Nikolet Pavlova, Katya B Popova, Martina Traykovska, Robert Penchovsky, “Why some Riboswitches are Suitable Targets for Antibacterial Drug Discovery”, EC Microbiology, 2020 https://www.researchgate.net/publication/349699835_EC_MICROBIOLOGY_EC_MICROBIOLOGY_Mini_Review_Why_Some_Riboswitches_are_Suitable_Targets_for_Antibacterial_Drug_Discovery
17. Aikaterini Valsamatzi-Panagiotou, Martina Traykovska, Robert Penchovsky, “Mechanisms of antibacterial drug resistance and approaches to overcome”, Drug Discovery Targeting Drug-Resistant Bacteria, 2020, ISBN: B978-0-12-818480-6.00002-3 https://www.sciencedirect.com/science/chapter/edited-volume/abs/pii/B9780128184806000023
18. Aikaterini Valsamatzi-Panagiotou, Martina Traykovska, Robert Penchovsky, ”Mechanisms of Drug resistance and Approaches to overcome it”, Elsevier, 2019 https://www.sciencedirect.com/science/chapter/edited-volume/abs/pii/B9780128184806000023
19. Robert Penchovsky, Martina Traykovska, “Synthetic Approaches to Biology: engineering gene control circuits, synthesizing, and editing genomes, Emerging Research on Bioinspired Materials Engineering”, IGI Global, DOI: 10.4018/978-1-4666-9811-6, 2016 https://www.igi-global.com/chapter/synthetic-approaches-tobiology/146511
20. Katya B Popova, Lozena A Otcheva, Martina Traykovska, Robert Penchovsky, “RNA as A Potent Target for Antibacterial Drug Discovery”, Biomedical Journal of Scientific and Technical Research, 2018, ISSN: 2574-1241, doi: 10.26717/BJSTR.2018.10.001938 https://biomedres.us/fulltexts/BJSTR.MS.ID.001938.php
21. Robert Penchovsky, Martina Traykovska, “Designing drugs that overcome antibacterial resistance: where do we stand and what should we do?” Expert opinion on drug discovery, doi: 10.1517/17460441.2015.1048219, 2015, IF 5.7 https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25981754/

Участие и ръководство на научни проекте:

Ръководител:

1. “Създаване на нови антибактериални агенти срещу резистентни щамове на Staphylococcus aureus и Enterococcus faecalis“, ФНИ на МОН, от 2022 г. до 2024 г.
2. “Създаване на антисенс олигонуклеотиди, които специфично инхибират бактериалния растеж на Porphyromonas gingivalis и Helicobacter pylori“, Финансираща иснтитуция ФНИ МОН, от 2019 г. до 2022 г.

Участник:

1. „Биоинформатичен и геномен анализ на иРНК (рибопревключватели и други), които се откриват в генома на макролидно-резистентни щамове Streptococcus pneumoniae инфектиращи човек“, КП-06-М93/1 от 08.12.2025г, № 2995, Финансираща иснтитуция ФНИ МОН, 2025 г. до 2027 г., ръководител гл. ас. д-р Николет Павлова
2. “Създаване на софтуерни системи за компютърен дизайн на бързи алостерични рибозими, които усещат присъствието на олигонуклеотиди с точно дефинирана секвенция и база данни за клинично значими генетични вариации при човека за кандидатстване за два патента“, Европейски сьюз, Европейска комисия, 2024 до 2026 г., Договор № 70-123-194/2.02.2024, ръководител проф. д-р Роберт Пенчовски
3. “Дизайн на антисенс олигoнуклеотиди свързани с клетъчно проникващи олигопептиди като нови антибактериални агенти срещу резистентни патогенни бактерии при човека за кандидатстване за европейски патент“, Европейски сьюз, Европейска комисия, 2023 до 2025 г., Договор № 70-123-505/05.07.2023 ръководител проф. д-р Роберт Пенчовски
4. “Сравнителен анализ на ефективността на нови антибактериални агенти базирани на различни антисенс олигонуклеотиди с използване на различни молекулни механизми на РНК инхибиране”, Финансираща институция ФНИ МОН, от 2022 до 2025 г.
5. “Дизайн на функционални нуклеинови киселини за синтетична рефулация на генната експресия при прокариоти и еукариоти”, Финансираща иснтитуция ФНИ МОН, от 2019 г. до 2022 г.
6. “Дизайн и експериментално тестване на химерни антисенс олигонуклеотиди като антибактериални агенти”, Финансираща иснтитуция ФНИ МОН, от 2017 г. до 2020 г.
7. “Прилагане на антисенс олигонуклеотиди като антибактериални агенти при Enterococcus faecalis”, Финансираща иснтитуция ФНИ СУ, 2020 г. до 2020 г.
8. “Антисенс олигонуклеотиди, които специфично се свързват с ФМН и САМ рибопревключватели при човешки патогенни бактерии”, Финансираща иснтитуция ФНИ СУ, от 2019 г. до 2019 г.
9. “Прилагане на антисенс олигонуклеотиди като антибактериални агенти при Staphylococcus aureus”, Финансираща иснтитуция ФНИ СУ, от 2018 г. до 2018 г.
10. “Нови методи за създаване на антибактериални агенти срещу Listeria monocytogenes, чрез използване на антисенс олигонуклеотиди”, Финансираща иснтитуция ФНИ СУ, 2018 г. до 2018 г.
11. “Нови методи за създаване на антибиотици срещу резистентни щамове Escherichia coli, чрез използване на антисенс олигонуклеотиди, които инхибират биохимични пътища контролирани от рибопревключватели”, Финансираща иснтитуция ФНИ СУ, от 2017 г. до 2017 г.
12. “Нови методи за откриване на антибиотични агенти срещу резистентни щамове на Staphylococcus aureus, чрез прилагане на антисенс олигонуклеотиди”, Финансираща иснтитуция ФНИ СУ, от 2016 г. до 2016 г.
13. “Приложение на антисенс олигонуклеотиди за специфично инхибиране на бактериални РНКи, като нов метод за създаване на антибиотици”, Финансираща иснтитуция ФНИ СУ, от 2015 г. до 2015 г.

Участие на научни конференции:

https://penchovsky.atwebpages.com/conferences.php

Участие с постер:

1. Мартина Трайковска, Прилагане на антисенс олигонуклеотиди като антибактериални агенти при Enteroccocus faecalis, Софийски фестивал на науката, 15/05-16/05 2021, по проект РД-22-838/2020 (избран за най-успешен проект в областта на Биологията)
2. Lozena A. Otcheva, Katya B. Popova, Martina Traykovska and Robert Penchovsky, „Control of gene expression by bacterial riboswitches and their application as drug targets“, 14th Congress of Microbiologists in Bulgaria with International Participation, 10/10-13/10 2018
3. Katya B. Popova, Lozena A. Otcheva, Martina Traykovska and Robert Penchovsky, „Probing general toxicity of antisense oligonucleotides to bacterial and mammalian cells“, Конференция: 14th Congress of Microbiologists in Bulgaria with International Participation, 10/10-13/10 2018

Участие със секционен доклад:

1. Мартина Трайковска, Роберт Пенчовски, „Engineering microfluidic and nucleic acid based biosensoring devices with versatile applications to modern biotechnology“, Международна конференция Bio science-development and new opportunities, 20-22 November, М20/11-22/11 2013